STIH Labuhanbatu terus berupaya meningkatkan kerjasama dengan Universitas dan instansi lain. Kerjasama ini untuk meningkatkan berbagai kemajuan seperti Visi & Misi serta menjalin silaturahmi dengan instansi – instansi tersebut. Kerjasama yang telah terjalin dalam bentuk MOU (Nota Kesepahaman Bersama) yaitu :

1. Universitas Muhammadiyah Tapanuli Selatan (UMTS) Padangsidimpuan
2. Kantor Biro Bantuan Hukum
3. Lembaga Pemasyarakatan (LP) Rantauprapat
4. Komisi Pemilihan Umum (KPU) Rantauprapat
5. Polres Labuhanbatu
6. Pengadilan Negari Rantauprapat
7. Bank Rakyat Indonesia (BRI) Simpang Enam Cabang Rantauprapat
8. Komisi Nasional Hak Asasi Manusia Republik Indonesia